Marc Márquez (Repsol Honda RC 213 V) mantuvo su línea ascendente en la tercera tanda de entrenamientos libres para el Gran Premio de San Marino de MotoGP disputados en el circuito «Marco Simoncelli» de Misano Adriático, por delante del talaverano Álvaro Bautista, que acabó sexto.
Mientras Márquez se mostró intratable desde el primero hasta el último minuto, su compañero de escudería tuvo algunos problemas para incrementar su ritmo y casi al final de los entrenamientos, cuando buscaba arañar algunas décimas a su registro se fue por los suelos al perder adherencia la rueda delantera de su moto.
Dani Pedrosa no se produjo ningún daño pero ya no pudo arrancar su Repsol Honda RC 213 V y tuvo que regresar por otros medios hasta su taller, aunque como mal menor ninguno de sus rivales pudo arrebatarle la segunda plaza, a 149 milésimas de segundo de Márquez. El líder del mundial de MotoGP fue el único que logró romper la barrera del minuto y 34 segundos al rodar en 1:33.976, todavía por encima del récord del circuito, en poder de Jorge Lorenzo (1:33.906) y del récord de vuelta más rápida, del australiano Casey Syoner (Repsol Honda RC 213 V) con 1:33.138 y en ambos casos conseguidos en la temporada 2011.
La cuarta plaza fue para el italiano Valentino Rossi (Yamaha YZR M 1), que acabó a poco más de tres décimas de segundo de Marc Márquez y que fue noticia por estrenar un nuevo diseño de casco en memoria de su amigo fallecido Marco Simoncelli, de quien recibe el nombre el circuito de Misano Adriático con una simbólica leyenda extraída de una canción del grupo Pink Floyd que dice «Wish you were here» o lo que es lo mismo «Me gustaría que estuvieras aquí».
Su particular homenaje al fallecido Simoncelli no le permitió pasar más allá de la cuarta posición, a poco más de tres décimas de segundo de Márquez, pero en cualquier caso con un ritmo muy semejante a los pilotos que le antecedieron y que todos deben refrendar en las tandas de clasificación vespertinas.