La Federación Española de Fútbol llevó a cabo el sorteo para determinar los emparejamientos de la fase previa y los dieciseisavos de final de la Copa Federación una vez que la competición ha entrado en la fase nacional.
Para cuadrar el número de equipos en los dieciseisavos de final ha sido necesaria una eliminatoria previa, que se celebrará los días 7 y 14 de noviembre, cuyo sorteo ha determinado que la disputen los clubes Atlético Pinto y CD Puerta Bonita.
Asimismo, Deportivo Guadalajara, CD Toledo y UD Almansa son los equipos castellano-manchegos inmersos en esta competición, los dos primeros por haber sido eliminados en la primera ronda de la Copa del Rey y el tercero en su condición de campeón autonómico de la Copa Federación
El sorteo de dieciseisavos de final ha deparado los siguientes emparejamientos de los equipos regionales: Guadalajara-Tenerife B; Granadilla-Toledo; y Almansa contra el campeón de la eliminatoria entre el Pinto y el Puerta Bonita.
Los encuentros de la eliminatoria de dieciseisavos se celebrarán los días 28 de noviembre (ida) y 19 de diciembre (vuelta).